在上海进行胎儿亲子鉴定时，无创与有创亲子鉴定的抉择需综合考虑安全性、适用孕周、检测目的等因素，以下是详细分析：
安全性方面无创胎儿亲子鉴定：安全性最高。孕6周以上即可进行，仅需采集孕妇10-15ml静脉血，利用基因测序技术提取胎儿游离DNA，与疑似父亲样本比对。全程无创伤，不接触子宫内环境，避免了穿刺操作可能引发的流产、感染等风险，对孕妇和胎儿几乎无生理伤害。
有创胎儿亲子鉴定：包括绒毛取样和羊水穿刺两种。绒毛取样通常在孕11-13周+6天进行，流产风险约为0.5%-1%，因绒毛组织与子宫壁联系紧密，穿刺可能刺激子宫收缩，还可能引发感染风险。羊水穿刺一般在孕16-24周进行，流产风险约为0.3%-0.5%，可能损伤胎儿、引发羊水渗漏，还可能增加宫内感染概率。
适用孕周方面无创胎儿亲子鉴定：适用孕周范围广，怀孕满6周以上（以B超确认孕周为准）直至分娩前均可进行。
有创胎儿亲子鉴定：绒毛取样适用于怀孕9-14周，羊水穿刺适用于怀孕16-24周。
检测准确性方面无创胎儿亲子鉴定：准确率极高，通常可达99.9999%以上。
有创胎儿亲子鉴定：准确性也非常高，与出生后结果一致，因为直接获取了胎儿的样本。
检测费用方面无创胎儿亲子鉴定：费用相对较低，大约在4000元至4500元之间。
有创胎儿亲子鉴定：费用较高，一般在7000元以上，还可能需要另外支付手术费用。
特殊情况无创胎儿亲子鉴定：极少数情况可能因孕妇血液中胎儿DNA浓度不足导致检测失败，需重新采样。若孕妇接受过器官移植、输血或为异卵双胞胎，可能影响结果准确性，需提前告知机构。
有创胎儿亲子鉴定：适合在孕早期因特殊原因需紧急确认亲子关系，且孕妇无妇科炎症、无流产史，经B超确认胎盘位置适合穿刺的情况。
总体而言，若无医学上的特殊需求，无创胎儿亲子鉴定是大多数孕妇的首选，其安全性高、适用孕周广、费用相对合理。但如果存在一些特殊情况，如孕早期急需确认亲子关系且孕妇身体条件允许等，在充分了解并愿意承担有创操作风险的前提下，可考虑有创胎儿亲子鉴定。无论选择哪种方式，都要选择具备法医物证鉴定资质的正规机构。
